魚缸過濾棉一般放在過濾盒的第一層，也就是靠近進水口的地方。過濾棉可以起到物理過濾的效果，當水流經過的時候，水中的雜質會被過濾棉濾除，從而讓它變得清澈。另外，長期使用的過程中，過濾棉還會讓硝化細菌能夠得以附着，也能起到生物過濾的功效，對水質有很好的維持作用。
