瑪麗球的公母很好區分。從個頭上看，同年出生的魚，雌性要比雄性更大一些。看顏色的話，雄性瑪麗魚的尾巴和背鰭往往是彩色的，這一點和雌性不同。另外，雄魚的臀鰭是它的交接器，而雌魚是正常的，雄魚的背鰭也是雌魚的兩倍高。到了繁殖期，雌性的腹部還會膨大。
